Biología molecular y genómica funcional de organismos acuáticos
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raul.llera@ola.icmyl.unam.mx
Dr. Raúl Antonio Llera Herrera
Mi principal interés de investigación es la generación de recursos genómicos para especies de interés ecológico y/o acuícola. La aproximación se basa en la secuenciación y anotación de novo de transcritos y genomas completos; exploramos los perfiles de expresión génica entre órganos, estadios de vida o tratamientos experimentales, para establecer potenciales mecanismos de regulación génica. De esta aproximación provienen aquellos marcadores útiles para comprender procesos moleculares, fisiológicos, ecológicos y/o evolutivos, que son posteriormente analizados mediante diversas metodologías (qPCR, hibridación in situ, genotipificación, etc.).
Una línea de investigación es el desarrollo de procedimientos para editar el genoma en especies acuáticas, empleando estrategias dirigidas como CRISPR/Cas9. Esto permite comprender la función de genes (por defecto o disfunción), así como para el descubrimiento de fenotipos de interés o con potencial aplicación biotecnológico.
Formación Profesional
Licenciatura
Biólogo Marino – Universidad Autónoma de Baja California Sur, México. (2002-2006)
Maestría
Uso, Manejo y Preservación de Recursos Naturales, CIBNOR S.C. México (2006-2008)
Doctorado
Uso, Manejo y Preservación de Recursos Naturales, CIBNOR S.C. México (2008-2012)
Postdoctorado
CONACyT en Laboratorio de Genética y Mejoramiento Animal Acuícola – CIBNOR (2012-2013)
Postdoctorado en ICMyL-UNAM Unidad Mazatlán (2014)
Formación Profesional
Licenciatura
Biólogo Marino – Universidad Autónoma de Baja California Sur, México. (2002-2006)
Maestría
Uso, Manejo y Preservación de Recursos Naturales, CIBNOR S.C. México (2006-2008)
Doctorado
Uso, Manejo y Preservación de Recursos Naturales, CIBNOR S.C. México (2008-2012)
Postdoctorado
CONACyT en Laboratorio de Genética y Mejoramiento Animal Acuícola – CIBNOR (2012-2013)
Postdoctorado en ICMyL-UNAM Unidad Mazatlán (2014)
Publicaciones
Laboratorio de Genómica Funcional en Organismos Acuáticos
El laboratorio de nueva creación, para la preparación de muestras y análisis de expresión génica en organismos acuáticos, con énfasis en la caracterización de genomas y transcriptomas de novo, y para el desarrollo de experimentos analizados mediante transcriptómica comparativa (RNA-seq). El entrenamiento en metodologías informáticas para el análisis de información genómica pública y generada por el laboratorio.
Contamos con equipos para extracción separación y fotodocumentación de ácidos nucléicos, PCR en Tiempo Real (qPCR), así como estaciones de trabajo para análisis bioinformáticos y acceso a servidores de alto rendimiento en la nube.
Algunas investigaciones en curso son:
- Anotación del transcriptoma e identificación de marcadores genéticos en el robalo del Pacífico Centropomus viridis.
- Transcriptómica comparativa de líneas genéticas de camarón blanco (Litopenaeus vannamei)
- Transcriptoma comparativo del hígado del pargo flamenco (Lutjanus guttatus) sometido a dietas con sustitución protéica
- Papel del ácido retinoico en la regulación meiótica del pargo flamenco
**Contáctame si te interesa alguna línea de investigación para realizar tu tesis de licenciatura, maestría do doctorado; con mucho gusto te daré más información sobre proyectos específicos y becas disponibles**
Instituciones con las que se participa:
División de Investigaciones Biológicas; Universidad Juárez Autónoma de Tabasco
Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C.,
Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.
Facultad de Ciencias Marinas, Universidad Autónoma de Baja California
Laboratorio de Genómica Funcional en Organismos Acuáticos
El laboratorio de nueva creación, para la preparación de muestras y análisis de expresión génica en organismos acuáticos, con énfasis en la caracterización de genomas y transcriptomas de novo, y para el desarrollo de experimentos analizados mediante transcriptómica comparativa (RNA-seq). El entrenamiento en metodologías informáticas para el análisis de información genómica pública y generada por el laboratorio.
Contamos con equipos para extracción separación y fotodocumentación de ácidos nucléicos, PCR en Tiempo Real (qPCR), así como estaciones de trabajo para análisis bioinformáticos y acceso a servidores de alto rendimiento en la nube.
Algunas investigaciones en curso son:
- Anotación del transcriptoma e identificación de marcadores genéticos en el robalo del Pacífico Centropomus viridis.
- Transcriptómica comparativa de líneas genéticas de camarón blanco (Litopenaeus vannamei)
- Transcriptoma comparativo del hígado del pargo flamenco (Lutjanus guttatus) sometido a dietas con sustitución protéica
- Papel del ácido retinoico en la regulación meiótica del pargo flamenco
**Contáctame si te interesa alguna línea de investigación para realizar tu tesis de licenciatura, maestría do doctorado; con mucho gusto te daré más información sobre proyectos específicos y becas disponibles**
Instituciones con las que se participa:
División de Investigaciones Biológicas; Universidad Juárez Autónoma de Tabasco
Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C.,
Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.
Facultad de Ciencias Marinas, Universidad Autónoma de Baja California