La Dra. Machain es especialista en Micropaleontología de organismos calcáreos (foraminíferos, ostrácodos) y su aplicación en estudios de cambio climático, geomorfología costera y contaminación marina, natural y de origen antropogénico. Actualmente participa en proyectos a cerca de los efectos de la industria petrolera en el sur del Golfo de México sobre el microbentos marino y su recuperación posterior a eventos de derrames de petróleo; en el desarrollo de “zonas muertas” (hipóxicas) en la descarga del río Usumacinta y su evolución en los últimos cien años; sobre la variabilidad climática del último siglo en el Pacífico mexicano y en la calibración de foraminíferos y diatomeas para estudios paleoclimáticos a través de estudios ecológicos y de monitoreo continuo (trampas de sedimento).