En el transcurso de los años el equipo de trabajo de este laboratorio ha realizado proyectos en las siguientes áreas de investigación:
1. Interacciones vegetación - medio ambiente, especialmente la eutrofización.
2. Interacción planta - animal, entre otros el impacto de las tortugas verdes sobre las comunidades de pastos marinos.
3. Impacto de las recientes afluencias masivas de Sargassum spp. sobre las praderas de pastos marinos.
4. Ecología reproductiva. Los pastos marinos son plantas con flores y existen muchos enigmas respecto a los procesos de polinización, desarrollo de estructuras reproductoras e incluso la importancia de la reproducción sexual en estas plantas marinas.
5. Biología clonal. Los pastos marinos son plantas clonales que implica que se extienden vegetativamente a través de estolones abajo del sedimento, que es un mecanismo de expansión sumamente eficaz en el ambiente marino
6. Genética poblacional. Ciertas preguntas, tales como el tamaño y edad de los clones, la importancia de la reproducción sexual o la conectividad entre poblaciones solo se pueden responder acudiendo a técnicas moleculares.
7. Restauración de pastos marinos. Iniciamos un proyecto piloto para optimizar técnicas de restauración de praderas para los sistemas arrecifales caribeños.
8. Carbono azul. Los pastizales marinos en conjunto con los marismas y manglares tienen la capacidad de secuestrar carbono, mitigando el efecto de cambio climático global; estudiamos cual es la capacidad de secuestro de praderas en el Caribe mexicano