Este laboratorio estudia las relaciones entre la diversidad de los organismos y su ambiente. La investigación que desarrollo usa como modelo la fauna asociada a los fondos marinos. Los estudios desarrollados a bordo de los buques de la UNAM B/O Justo Sierra y B/O El Puma y otros con colaboraciones internacionales caracterizan y explican los patrones de abundancia, biomasa, talla, distribución geográfica de la diversidad biológica de los fondos marinos a profundidades mayores de 200m.

La mayoria de lsoestudios macroecológicos en México se realizan en ecosistemas terrestres con extensas bases de datos existentes soble los alcances geográficos, la talla, la abundancia de las especies y las variables ambientales. La macro ecología provee una perspectiva útil y práctica para comprender la estructura y funcionamiento de los ecosistemas. En los mares, y en especial en el mar profundo, la macroecología es menos conocida. Esto es debido a que la investigación ecología en los ecosistemas de mar profundo iniciaron a mediados de los años 60s. Este retraso se debe a las vestedad de los mares, la dificultad de acceso a grandes profundidades y las condiciones extremas que han hecho su exploración técnicamente difícil y costosa.

En este laboratorio la macroecología es una estrategia que ha permitido conocer los factores que definen los patrones de diversidad en los fondos marinos d mar profundo en escales de muestro anual y multianual. Los resultados obtenidos a la fecha han reconocido que la estructura comunitaria varía en escalas espaciales local y regional y en escalas temporales anual y en ciclos mayores incluyendo el cambio global. La diversidad que caracteriza los fondos marinos varía localmente, ésta está definida por procesos oceanográficos com es la hipoxia, el hidrotermalismo, la infiltración de matano, el flujo de las partículas al fondo que operan en escalas temporales incluyendo el cambio global, desacopladas entre la columna de agua y el fondo marino.