Las investigaciones que se desarrollan en este laboratorio están encaminadas al estudio y conservación de la biodiversidad de ecosistemas costeros en el Golfo de México. Particularmente se contribuye con información ecológica del phylum Porifera y otros invertebrados bentónicos de interés para la conservación de los ecosistemas costeros. En el estado de Campeche, se ha estado realizando una caracterización biológica y ambiental en hábitats de praderas de pastos marinos, raíces sumergidas de manglares, fondos blandos y arrecifes de ostión. El frecuente monitoreo de estos ecosistemas nos ha permitido describir la dinámica de poblaciones de algunas especies de invertebrados que son clave para el ecosistema. También se ha estado realizando un seguimiento a largo plazo para examinar el estado de conservación de estos ecosistemas, a partir de los cambios en la estructura de la comunidad de los invertebrados.